根据脓肿的病变部位不同，其临床表现也不同：
1.肛门周围脓肿
肛门周围皮下脓肿最常见，常位于肛门后方或侧方皮下部，一般不大。疼痛、肿胀和局部压痛为主要表现。全身感染性症状不明显。
2.坐骨肛管间隙脓肿
又称坐骨直肠窝脓肿，由于坐骨直肠间隙较大，形成的脓肿亦较大而深。发病时患侧出现待续胀痛，逐渐加重，继而为待续性跳痛，排便或行走时加剧。全身感染症状明显，发热为最常见的临床症状。早期局部体征不明显，以后出现肛门患侧红肿，局部触诊或肛门指诊时患侧有深压痛，甚至波动感。
3.骨盆直肠间隙脓肿
由于此间隙位置深、空间大，引进的全身症状较重面局部症状不明显。早期就有全身中毒症状，如发热、寒战、全身疲倦不适。局部表现为直肠坠胀感，便不尽感。直肠指诊可在直肠壁上触及肿块隆起，有压痛和波动感。诊断主要靠穿刺抽脓，必要时做直肠超声或CT检查予以证实。
