原发性肠套叠病因不明，目前一般是以痉挛学说来解释。婴儿肠痉挛除体质上的特点外，最可能与食物过敏有关。此外，原发性肠套叠也可并发于手术后、蛔虫病、过敏性紫癜等。原发性肠套叠多见于6个月至1.5岁的婴儿。